民國六十八年八月奉令設深坑分部，派石碇國中校長郭楚新先生為籌備主任，學生三班，由於校舍尚未興建，借用深坑國小教室上課，六十九年二月教室次第完成，即遷入新校舍上課。
　　民國七十一年八月一日，本校奉准獨立設校，正式為台北縣立深坑國民中學，省政府調派石門國中校長陸竹松先生為首任校長，於八月二十八日正式就職。
　　民國七十三年八月奉准附設國民中學補習學校，招收深坑、石碇、平溪等三鄉失學民眾，以解決就學問題，並提昇國民教育水準。
　　民國七十八年八月一日，原任校長陸竹松先生屆齡奉准退休，省政府派何金針女士為本校第二任校長，並於九月一日接篆視事。
　　民國七十九年八月一日，奉令成立啟智班，使身心障礙者，獲得更好照顧及學習，以達有教無類，因材施教的目標。
　　民國八十一年八月一日，校長何金針女士屆滿榮調，省政府派新竹縣立尖石國中校長李懿道女士為本校第三任校長，並於八月二十六日接篆視事。
　　民國八十三年八月一日，校長李懿道女士屆滿榮調，省政府派新竹縣立華山國中校長吳松溪先生為本校第四任校長，並於八月二十八日接篆視事。
　　民國八十四年八月奉淮附設技藝教育中心，提供本校及石碇、平溪等國中，有職業傾向學生，協助其發揮潛能，習得一技之長，立足社會，開拓一片美好天空。
　　民國八十五年八月一日，吳校長松溪屆滿榮調，省政府派林蕙質女士為本校第五任校長，並於八月二十三日接篆視事。
　　民國八十八年八月一日，林校長蕙質屆滿榮調，臺北縣政府遴聘平溪國中校長鄭秋榮先生為本校第六任校長。鄭校長任職後大力提倡多元智能之教學，推展小班教學的精神不遺餘力，加強生活教育，期五育均衡發展。
　　民國八十九年八月奉縣府令設置幼稚園一班。
　　民國九十二年八月一日，鄭校長秋榮屆滿榮調，臺北縣政府遴聘台北縣竹圍國中宋宏明先生為本校第七任校長。宋校長任職後秉持「尊重、關懷」的人本精神，推動「愛與榜樣」的品格教育，發展「社區有教室」的學校本位課程及永續校園改造工程，同時增進深坑國中、小的互動，以期成就一個有尊嚴、有自信且能自我實現的社會人。

　　民國九十六年八月一日，宋校長宏明屆滿榮調，臺北縣政府遴聘台北縣漳和圍國中羅珮瑜女士為本校第八任校長。
　　本校校地面積共七干五百餘坪，92學年度16班，93學年度17班，94學年度19班，95學年度21班，96學年度23班，97學年度26班（普通班24班，特教班1班，幼稚園1班），教職員工共七十五人，學生約七百七十餘人。教師平日本諸『忠、信、篤、敬』傳統校訓，以「尊重、關懷」的人本精神，培養學生「卓越、多元」的健全人格，孕育社會良好國民。